برای درمان زگیل راههای درمانی مختلفی مانند تجویز داروهای موضعی، لیزر، سوزاندن با حرارت، منجمدکردن و.. وجود دارد. میزان موثربودن و عوارض هر یک از این روشهای درمانی متفاوت است. هیچ درمانی وجود ندارد که بتواند صددرصد، ضایعات زگیلی را از بین ببرد و از عود آنها جلوگیری کند.